Żalgiris KownoW litewskim sporcie nazwa Žalgiris Kowno przez dekady kojarzyła się niemal wyłącznie z legendarną sekcją koszykówki, jednak w 2025 roku piłkarska gałąź tej samej organizacji napisała własny, historyczny rozdział. FK Kauno Žalgiris, założony w 2004 roku jako FM Spyris Kaunas przez trenerów kowieńskiej szkółki piłkarskiej Tauras, oficjalnie przyjął nazwę nawiązującą do koszykarskiego giganta na początku sezonu 2016, po dwuletnim sporze prawnym o prawo do jej używania. Po latach stopniowego budowania pozycji w A Lydze – najwyższej klasie rozgrywkowej Litwy – klub w 2025 roku zdobył pierwsze w swojej historii mistrzostwo kraju, kończąc sezon z bilansem 75 punktów i przewagą ośmiu punktów nad wicemistrzem, FC Hegelmann.
Historyczny triumf otworzył drużynie drogę do debiutu w eliminacjach Ligi Mistrzów UEFA. Latem 2026 roku Żalgiris Kowno wyeliminował w pierwszej rundzie kwalifikacyjnej kosowską Dritę Gjilan, wygrywając dwumecz 4:3, a w drugiej rundzie pokonał ormiańską Araratę-Armenia 1:0 w dwumeczu – były to pierwsze w historii klubu zwycięstwa w fazie eliminacyjnej Ligi Mistrzów. Sukces sportowy uzupełnił zdobyty na początku 2026 roku Superpuchar Litwy, wywalczony po zwycięstwie 1:0 nad Panevėžys.
Mimo tego przełomu, piłkarska sekcja Żalgirisu wciąż pozostaje w cieniu koszykarskiego odpowiednika, który dzięki występom w Euromedia i wieloletniej dominacji na Litwie generuje nieporównywalnie większe zainteresowanie medialne i frekwencyjne. Klub jest własnością dyrektora generalnego Euroligi Pauliusa Motiejūnasa oraz litewskiej legendy koszykówki Mantasa Kalnietisa, pełniącego funkcję prezesa. Warto również zauważyć, że w międzynarodowych rankingach UEFA kowianie bywają mylnie utożsamiani ze swoim stołecznym imiennikiem, FK Žalgiris Wilno – klubem starszym, znacznie bardziej utytułowanym na arenie krajowej, lecz do niedawna wyprzedzającym Kowno właśnie pod względem osiągnięć ligowych.
Mecze domowe zespół rozgrywa na stadionie im. Stepona Dariusa i Stasysa Girėnasa w Kownie, obiekcie o pojemności ponad 15 tysięcy miejsc, który stał się areną historycznego sezonu klubu. Drużyna występuje w zielono-białych barwach, przyjętych wraz z nazwą Żalgiris i symbolizujących więź z koszykarskim rodowodem organizacji.
